Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hs3st6Q5GFD5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hs3st6Q5GFD5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hs3st6Q5GFD5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hs3st6Q5GFD5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hs3st6Q5GFD5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hs3st6Q5GFD5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hs3st6Q5GFD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hs3st6Q5GFD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms