Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Srbd1Q497V5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Srbd1Q497V5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Srbd1Q497V5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Srbd1Q497V5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Srbd1Q497V5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Srbd1Q497V5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Srbd1Q497V5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Srbd1Q497V5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms