Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc114Q3UX62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc114Q3UX62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ccdc114Q3UX62 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc114Q3UX62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc114Q3UX62 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc114Q3UX62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc114Q3UX62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc114Q3UX62 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms