Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skap1Q3UUV5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Skap1Q3UUV5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Skap1Q3UUV5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Skap1Q3UUV5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Skap1Q3UUV5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Skap1Q3UUV5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Skap1Q3UUV5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Skap1Q3UUV5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Skap1Q3UUV5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Skap1Q3UUV5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Skap1Q3UUV5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms