Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syndig1lQ3USQ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syndig1lQ3USQ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syndig1lQ3USQ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syndig1lQ3USQ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syndig1lQ3USQ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syndig1lQ3USQ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syndig1lQ3USQ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syndig1lQ3USQ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms