Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cog7Q3UM29 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cog7Q3UM29 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Cog7Q3UM29 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cog7Q3UM29 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cog7Q3UM29 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cog7Q3UM29 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cog7Q3UM29 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cog7Q3UM29 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cog7Q3UM29 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms