Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc106Q3ULM0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc106Q3ULM0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc106Q3ULM0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc106Q3ULM0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc106Q3ULM0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc106Q3ULM0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc106Q3ULM0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms