Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lmtk2Q3TYD6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lmtk2Q3TYD6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lmtk2Q3TYD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Lmtk2Q3TYD6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lmtk2Q3TYD6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Lmtk2Q3TYD6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lmtk2Q3TYD6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Lmtk2Q3TYD6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lmtk2Q3TYD6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Lmtk2Q3TYD6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Lmtk2Q3TYD6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Lmtk2Q3TYD6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lmtk2Q3TYD6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lmtk2Q3TYD6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Lmtk2Q3TYD6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Lmtk2Q3TYD6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Lmtk2Q3TYD6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lmtk2Q3TYD6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lmtk2Q3TYD6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Lmtk2Q3TYD6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lmtk2Q3TYD6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lmtk2Q3TYD6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Lmtk2Q3TYD6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lmtk2Q3TYD6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Lmtk2Q3TYD6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lmtk2Q3TYD6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Lmtk2Q3TYD6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Lmtk2Q3TYD6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lmtk2Q3TYD6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
Lmtk2Q3TYD6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Lmtk2Q3TYD6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Lmtk2Q3TYD6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Lmtk2Q3TYD6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Lmtk2Q3TYD6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lmtk2Q3TYD6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lmtk2Q3TYD6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Lmtk2Q3TYD6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Lmtk2Q3TYD6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Lmtk2Q3TYD6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Lmtk2Q3TYD6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lmtk2Q3TYD6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lmtk2Q3TYD6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Lmtk2Q3TYD6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Lmtk2Q3TYD6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Lmtk2Q3TYD6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Lmtk2Q3TYD6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lmtk2Q3TYD6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lmtk2Q3TYD6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Lmtk2Q3TYD6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Lmtk2Q3TYD6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Lmtk2Q3TYD6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Lmtk2Q3TYD6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Lmtk2Q3TYD6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Lmtk2Q3TYD6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Lmtk2Q3TYD6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lmtk2Q3TYD6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Lmtk2Q3TYD6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms