Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pbxip1Q3TVI8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pbxip1Q3TVI8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pbxip1Q3TVI8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pbxip1Q3TVI8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pbxip1Q3TVI8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pbxip1Q3TVI8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pbxip1Q3TVI8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pbxip1Q3TVI8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pbxip1Q3TVI8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Pbxip1Q3TVI8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbxip1Q3TVI8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pbxip1Q3TVI8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbxip1Q3TVI8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pbxip1Q3TVI8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pbxip1Q3TVI8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Pbxip1Q3TVI8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbxip1Q3TVI8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pbxip1Q3TVI8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pbxip1Q3TVI8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pbxip1Q3TVI8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pbxip1Q3TVI8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pbxip1Q3TVI8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pbxip1Q3TVI8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pbxip1Q3TVI8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms