Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB02

Nfkbid, NF-kappa-B inhibitor delta, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbidQ2TB02 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NfkbidQ2TB02 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NfkbidQ2TB02 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NfkbidQ2TB02 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NfkbidQ2TB02 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NfkbidQ2TB02 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NfkbidQ2TB02 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NfkbidQ2TB02 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NfkbidQ2TB02 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfkbidQ2TB02 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NfkbidQ2TB02 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NfkbidQ2TB02 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms