Protein–RNA interactions for Protein: Q2EG98

Pkd1l3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l3Q2EG98 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkd1l3Q2EG98 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pkd1l3Q2EG98 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pkd1l3Q2EG98 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pkd1l3Q2EG98 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pkd1l3Q2EG98 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pkd1l3Q2EG98 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pkd1l3Q2EG98 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pkd1l3Q2EG98 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pkd1l3Q2EG98 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd1l3Q2EG98 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd1l3Q2EG98 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pkd1l3Q2EG98 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pkd1l3Q2EG98 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms