Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Samd11Q1RNF8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Samd11Q1RNF8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Samd11Q1RNF8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Samd11Q1RNF8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Samd11Q1RNF8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samd11Q1RNF8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samd11Q1RNF8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Samd11Q1RNF8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Samd11Q1RNF8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samd11Q1RNF8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Samd11Q1RNF8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Samd11Q1RNF8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Samd11Q1RNF8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms