Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cntnap5aQ0V8T9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cntnap5aQ0V8T9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cntnap5aQ0V8T9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cntnap5aQ0V8T9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cntnap5aQ0V8T9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cntnap5aQ0V8T9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cntnap5aQ0V8T9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cntnap5aQ0V8T9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cntnap5aQ0V8T9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cntnap5aQ0V8T9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cntnap5aQ0V8T9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cntnap5aQ0V8T9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cntnap5aQ0V8T9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cntnap5aQ0V8T9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cntnap5aQ0V8T9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cntnap5aQ0V8T9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms