Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37,44■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,42■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37,39■■■■□ 3,58
Vps8Q0P5W1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,38■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,37■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37,36■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,34■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,33■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC37,32■■■■□ 3,57
Vps8Q0P5W1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37,32■■■■□ 3,56
Vps8Q0P5W1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Vps8Q0P5W1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Vps8Q0P5W1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,29■■■■□ 3,56
Vps8Q0P5W1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Vps8Q0P5W1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37,27■■■■□ 3,56
Vps8Q0P5W1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC37,25■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,22■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37,21■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Vps8Q0P5W1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,16■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC37,15■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,14■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,14■■■■□ 3,54
Vps8Q0P5W1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Vps8Q0P5W1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,1■■■■□ 3,53
Vps8Q0P5W1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Vps8Q0P5W1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Vps8Q0P5W1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Vps8Q0P5W1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Vps8Q0P5W1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,02■■■■□ 3,52
Vps8Q0P5W1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Vps8Q0P5W1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Vps8Q0P5W1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Vps8Q0P5W1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Vps8Q0P5W1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3,51
Vps8Q0P5W1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36,99■■■■□ 3,51
Vps8Q0P5W1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Vps8Q0P5W1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Vps8Q0P5W1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36,91■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36,9■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Vps8Q0P5W1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Vps8Q0P5W1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Vps8Q0P5W1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Vps8Q0P5W1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Vps8Q0P5W1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Vps8Q0P5W1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Vps8Q0P5W1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,79■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36,77■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36,76■■■■□ 3,48
Vps8Q0P5W1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,76■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36,76■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Vps8Q0P5W1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms