Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fbln1Q08879 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Fbln1Q08879 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fbln1Q08879 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Fbln1Q08879 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Fbln1Q08879 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fbln1Q08879 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fbln1Q08879 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbln1Q08879 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Fbln1Q08879 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fbln1Q08879 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fbln1Q08879 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fbln1Q08879 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fbln1Q08879 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fbln1Q08879 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fbln1Q08879 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fbln1Q08879 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fbln1Q08879 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fbln1Q08879 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fbln1Q08879 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms