Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AmbpQ07456 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AmbpQ07456 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AmbpQ07456 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AmbpQ07456 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AmbpQ07456 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
AmbpQ07456 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AmbpQ07456 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms