Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Epha4Q03137 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Epha4Q03137 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Epha4Q03137 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Epha4Q03137 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Epha4Q03137 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Epha4Q03137 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Epha4Q03137 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Epha4Q03137 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Epha4Q03137 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Epha4Q03137 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Epha4Q03137 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epha4Q03137 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Epha4Q03137 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epha4Q03137 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms