Protein–RNA interactions for Protein: Q03059

Chat, Choline O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChatQ03059 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChatQ03059 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChatQ03059 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChatQ03059 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChatQ03059 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChatQ03059 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChatQ03059 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChatQ03059 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChatQ03059 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChatQ03059 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChatQ03059 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChatQ03059 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChatQ03059 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChatQ03059 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChatQ03059 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChatQ03059 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChatQ03059 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChatQ03059 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChatQ03059 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChatQ03059 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChatQ03059 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChatQ03059 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChatQ03059 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChatQ03059 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChatQ03059 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChatQ03059 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ChatQ03059 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChatQ03059 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChatQ03059 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChatQ03059 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ChatQ03059 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChatQ03059 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChatQ03059 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChatQ03059 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChatQ03059 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChatQ03059 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ChatQ03059 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms