Protein–RNA interactions for Protein: Q01081

U2AF1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1Q01081 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 35.9
U2AF1Q01081 EIF4G3-202ENST00000356916 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.471e-10■■■■■ 35.9
U2AF1Q01081 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 35.9
U2AF1Q01081 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 35.9
U2AF1Q01081 HOOK3-205ENST00000533338 774 ntTSL 36.8□□□□□ -1.321e-10■■■■■ 35.9
U2AF1Q01081 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.381e-10■■■■■ 35.9
U2AF1Q01081 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.734e-10■■■■■ 35.3
U2AF1Q01081 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.454e-10■■■■■ 35.3
U2AF1Q01081 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.872e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 INTS7-208ENST00000469606 4447 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 INTS7-206ENST00000461212 820 ntTSL 23.88□□□□□ -1.792e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 INTS7-209ENST00000475798 795 ntTSL 53.73□□□□□ -1.812e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 INTS7-207ENST00000462910 674 ntTSL 23.01□□□□□ -1.932e-10■■■■■ 35
U2AF1Q01081 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.935e-24■■■■■ 34.9
U2AF1Q01081 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.765e-24■■■■■ 34.9
U2AF1Q01081 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.355e-24■■■■■ 34.9
U2AF1Q01081 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.275e-24■■■■■ 34.9
U2AF1Q01081 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.285e-24■■■■■ 34.9
U2AF1Q01081 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.515e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-223ENST00000639150 1815 ntTSL 521.4■■□□□ 1.025e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-203ENST00000571698 2276 ntTSL 519.6■□□□□ 0.735e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-229ENST00000639531 2731 ntTSL 516.05■□□□□ 0.165e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.025e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-208ENST00000574590 5147 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.025e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-201ENST00000262419 5309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.095e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-205ENST00000572904 4973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.485e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-231ENST00000639853 1425 ntTSL 510.35□□□□□ -0.755e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 KANSL1-226ENST00000639375 3392 ntTSL 510.29□□□□□ -0.765e-9■■■■■ 34.5
U2AF1Q01081 PPP2R2D-207ENST00000616467 2058 ntTSL 1 (best)33.86■■■■□ 3.013e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.183e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PPP2R2D-204ENST00000482010 1792 ntTSL 224.7■■□□□ 1.553e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PPP2R2D-205ENST00000490777 1462 ntTSL 1 (best)22.38■■□□□ 1.173e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PPP2R2D-203ENST00000472664 770 ntTSL 319.26■□□□□ 0.673e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.333e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PPP2R2D-202ENST00000470416 6203 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PIAS1-203ENST00000562190 766 ntTSL 35.79□□□□□ -1.483e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PIAS1-206ENST00000564915 671 ntTSL 55.4□□□□□ -1.543e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 PPP2R2D-206ENST00000517472 573 ntTSL 33.21□□□□□ -1.93e-9■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 C2orf42-212ENST00000470096 579 ntTSL 421.78■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.071e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-210ENST00000474809 915 ntTSL 517.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-204ENST00000416149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-211ENST00000477044 904 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-207ENST00000454815 911 ntTSL 55.82□□□□□ -1.481e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 TIA1-202ENST00000361692 543 ntTSL 51.69□□□□□ -2.141e-8■■■■■ 34.3
U2AF1Q01081 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.337e-29■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.274e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-217ENST00000526917 663 ntTSL 316.19■□□□□ 0.184e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-213ENST00000486942 2529 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-214ENST00000489990 1012 ntTSL 512.75□□□□□ -0.374e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-220ENST00000531061 530 ntTSL 49.86□□□□□ -0.834e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.854e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-219ENST00000528603 779 ntTSL 49.38□□□□□ -0.914e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-204ENST00000435274 2670 ntTSL 59.15□□□□□ -0.954e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-210ENST00000475697 3375 ntTSL 28.98□□□□□ -0.974e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-215ENST00000495776 2831 ntTSL 28.73□□□□□ -1.014e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.024e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-223ENST00000532975 581 ntTSL 47.14□□□□□ -1.274e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 OSBPL9-221ENST00000531819 4520 ntTSL 26.29□□□□□ -1.44e-10■■■■■ 34.2
U2AF1Q01081 STAG3L5P-207ENST00000493499 751 ntTSL 215.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 34.1
U2AF1Q01081 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.223e-7■■■■■ 34
U2AF1Q01081 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 34
U2AF1Q01081 STX2-202ENST00000344271 661 ntTSL 35.36□□□□□ -1.553e-7■■■■■ 34
U2AF1Q01081 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.581e-7■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 RHOBTB3-210ENST00000510313 990 ntTSL 25.68□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.511e-7■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 WSB1-216ENST00000584114 479 ntTSL 34.4□□□□□ -1.714e-21■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.517e-9■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 AUH-205ENST00000478465 751 ntTSL 327.99■■■□□ 2.077e-9■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 27e-9■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 AUH-204ENST00000475023 641 ntTSL 212.29□□□□□ -0.447e-9■■■■■ 33.9
U2AF1Q01081 SDR39U1-211ENST00000555355 934 ntTSL 219.15■□□□□ 0.669e-12■■■■■ 33.5
U2AF1Q01081 RMND1-203ENST00000444024 743 ntTSL 320.08■□□□□ 0.816e-11■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-11■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.776e-11■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.642e-14■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 ATL2-203ENST00000405384 1905 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.482e-14■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-14■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.252e-14■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.112e-14■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 RMND1-201ENST00000336451 1413 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.366e-11■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-14■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.682e-14■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.277e-10■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.687e-10■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.687e-10■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 FKBP9P1-201ENST00000441699 1491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.167e-10■■■■■ 33.4
U2AF1Q01081 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.874e-9■■■■■ 33.2
Retrieved 100 of 10,096 protein–RNA pairs in 38.8 ms