Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brca2P97929 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca2P97929 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca2P97929 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Brca2P97929 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brca2P97929 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brca2P97929 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brca2P97929 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brca2P97929 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brca2P97929 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brca2P97929 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brca2P97929 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brca2P97929 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brca2P97929 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca2P97929 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brca2P97929 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brca2P97929 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brca2P97929 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brca2P97929 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brca2P97929 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Brca2P97929 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Brca2P97929 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Brca2P97929 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Brca2P97929 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brca2P97929 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Brca2P97929 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brca2P97929 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brca2P97929 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca2P97929 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms