Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmsP97355 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SmsP97355 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SmsP97355 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SmsP97355 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SmsP97355 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SmsP97355 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmsP97355 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SmsP97355 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmsP97355 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmsP97355 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SmsP97355 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SmsP97355 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmsP97355 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmsP97355 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmsP97355 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SmsP97355 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SmsP97355 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SmsP97355 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmsP97355 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmsP97355 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmsP97355 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SmsP97355 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SmsP97355 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmsP97355 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SmsP97355 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SmsP97355 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmsP97355 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SmsP97355 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmsP97355 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmsP97355 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SmsP97355 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SmsP97355 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SmsP97355 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmsP97355 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SmsP97355 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SmsP97355 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SmsP97355 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SmsP97355 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SmsP97355 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmsP97355 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SmsP97355 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SmsP97355 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SmsP97355 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SmsP97355 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmsP97355 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SmsP97355 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmsP97355 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SmsP97355 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmsP97355 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmsP97355 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmsP97355 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmsP97355 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SmsP97355 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmsP97355 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SmsP97355 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmsP97355 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmsP97355 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SmsP97355 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmsP97355 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SmsP97355 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmsP97355 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmsP97355 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SmsP97355 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SmsP97355 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmsP97355 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SmsP97355 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmsP97355 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SmsP97355 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmsP97355 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SmsP97355 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmsP97355 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmsP97355 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmsP97355 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SmsP97355 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SmsP97355 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SmsP97355 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SmsP97355 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SmsP97355 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SmsP97355 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SmsP97355 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SmsP97355 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SmsP97355 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SmsP97355 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmsP97355 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SmsP97355 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SmsP97355 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmsP97355 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmsP97355 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmsP97355 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmsP97355 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmsP97355 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SmsP97355 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms