Protein–RNA interactions for Protein: P84099

Rpl19, 60S ribosomal protein L19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl19P84099 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl19P84099 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rpl19P84099 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl19P84099 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rpl19P84099 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl19P84099 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl19P84099 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rpl19P84099 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rpl19P84099 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl19P84099 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl19P84099 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rpl19P84099 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl19P84099 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms