Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nucb2P81117 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nucb2P81117 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nucb2P81117 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nucb2P81117 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nucb2P81117 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Nucb2P81117 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nucb2P81117 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nucb2P81117 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms