Protein–RNA interactions for Protein: P70325

Tbx4, T-box transcription factor TBX4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx4P70325 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbx4P70325 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbx4P70325 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbx4P70325 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbx4P70325 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbx4P70325 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbx4P70325 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbx4P70325 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tbx4P70325 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tbx4P70325 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tbx4P70325 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tbx4P70325 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tbx4P70325 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tbx4P70325 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tbx4P70325 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbx4P70325 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tbx4P70325 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms