Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Plxna3P70208 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Plxna3P70208 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Plxna3P70208 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Plxna3P70208 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Plxna3P70208 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Plxna3P70208 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Plxna3P70208 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,27■■□□□ 1,8
Plxna3P70208 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Plxna3P70208 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Plxna3P70208 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Plxna3P70208 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Plxna3P70208 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Plxna3P70208 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,9■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Plxna3P70208 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms