Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psmc6P62334 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psmc6P62334 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Psmc6P62334 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Psmc6P62334 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Psmc6P62334 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Psmc6P62334 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Psmc6P62334 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Psmc6P62334 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Psmc6P62334 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Psmc6P62334 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Psmc6P62334 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Psmc6P62334 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Psmc6P62334 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms