Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ube2kP61087 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ube2kP61087 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ube2kP61087 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ube2kP61087 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ube2kP61087 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms