Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hps5P59438 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hps5P59438 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hps5P59438 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hps5P59438 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hps5P59438 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Hps5P59438 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hps5P59438 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hps5P59438 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hps5P59438 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hps5P59438 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hps5P59438 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hps5P59438 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hps5P59438 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hps5P59438 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Hps5P59438 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hps5P59438 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hps5P59438 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Hps5P59438 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hps5P59438 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hps5P59438 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hps5P59438 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hps5P59438 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hps5P59438 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.54■■■□□ 2
Hps5P59438 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hps5P59438 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hps5P59438 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Hps5P59438 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Hps5P59438 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hps5P59438 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hps5P59438 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hps5P59438 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Hps5P59438 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hps5P59438 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Hps5P59438 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hps5P59438 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hps5P59438 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hps5P59438 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hps5P59438 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hps5P59438 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hps5P59438 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms