Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Vps33bP59016 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Vps33bP59016 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Vps33bP59016 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Vps33bP59016 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Vps33bP59016 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Vps33bP59016 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Vps33bP59016 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Vps33bP59016 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Vps33bP59016 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Vps33bP59016 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Vps33bP59016 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Vps33bP59016 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Vps33bP59016 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Vps33bP59016 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Vps33bP59016 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Vps33bP59016 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Vps33bP59016 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Vps33bP59016 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Vps33bP59016 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Vps33bP59016 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Vps33bP59016 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Vps33bP59016 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Vps33bP59016 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Vps33bP59016 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms