Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GferP56213 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GferP56213 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GferP56213 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GferP56213 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GferP56213 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GferP56213 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GferP56213 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GferP56213 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GferP56213 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GferP56213 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GferP56213 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GferP56213 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GferP56213 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GferP56213 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GferP56213 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GferP56213 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GferP56213 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GferP56213 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GferP56213 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GferP56213 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GferP56213 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GferP56213 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GferP56213 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GferP56213 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GferP56213 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GferP56213 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GferP56213 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GferP56213 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GferP56213 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GferP56213 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GferP56213 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GferP56213 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GferP56213 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GferP56213 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GferP56213 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GferP56213 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GferP56213 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GferP56213 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GferP56213 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GferP56213 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GferP56213 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GferP56213 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GferP56213 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GferP56213 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GferP56213 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GferP56213 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GferP56213 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GferP56213 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GferP56213 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GferP56213 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GferP56213 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GferP56213 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GferP56213 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GferP56213 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GferP56213 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GferP56213 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GferP56213 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GferP56213 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GferP56213 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GferP56213 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GferP56213 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GferP56213 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GferP56213 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GferP56213 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GferP56213 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GferP56213 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GferP56213 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GferP56213 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GferP56213 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GferP56213 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GferP56213 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GferP56213 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GferP56213 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GferP56213 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GferP56213 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GferP56213 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GferP56213 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GferP56213 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GferP56213 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GferP56213 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GferP56213 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GferP56213 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GferP56213 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GferP56213 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GferP56213 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GferP56213 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GferP56213 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GferP56213 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GferP56213 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GferP56213 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GferP56213 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GferP56213 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms