Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh11P55288 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh11P55288 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh11P55288 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh11P55288 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh11P55288 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh11P55288 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms