Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RabggtbP53612 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RabggtbP53612 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RabggtbP53612 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RabggtbP53612 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RabggtbP53612 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RabggtbP53612 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RabggtbP53612 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RabggtbP53612 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RabggtbP53612 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RabggtbP53612 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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