Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cav1P49817 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cav1P49817 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cav1P49817 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cav1P49817 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cav1P49817 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cav1P49817 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Cav1P49817 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cav1P49817 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cav1P49817 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cav1P49817 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cav1P49817 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cav1P49817 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cav1P49817 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cav1P49817 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cav1P49817 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cav1P49817 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cav1P49817 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cav1P49817 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cav1P49817 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cav1P49817 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cav1P49817 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cav1P49817 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cav1P49817 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cav1P49817 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cav1P49817 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cav1P49817 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cav1P49817 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cav1P49817 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cav1P49817 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms