Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gadd45aP48316 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gadd45aP48316 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gadd45aP48316 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gadd45aP48316 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gadd45aP48316 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gadd45aP48316 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gadd45aP48316 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gadd45aP48316 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms