Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsf9P41274 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf9P41274 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf9P41274 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tnfsf9P41274 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnfsf9P41274 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfsf9P41274 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnfsf9P41274 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfsf9P41274 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1135.3 ms