Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mmp9P41245 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mmp9P41245 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mmp9P41245 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mmp9P41245 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp9P41245 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mmp9P41245 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mmp9P41245 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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