Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mmp12P34960 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mmp12P34960 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp12P34960 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp12P34960 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp12P34960 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp12P34960 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp12P34960 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms