Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cnga1P29974 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cnga1P29974 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cnga1P29974 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cnga1P29974 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cnga1P29974 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cnga1P29974 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cnga1P29974 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cnga1P29974 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cnga1P29974 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cnga1P29974 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cnga1P29974 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cnga1P29974 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cnga1P29974 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cnga1P29974 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cnga1P29974 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cnga1P29974 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cnga1P29974 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cnga1P29974 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Cnga1P29974 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cnga1P29974 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cnga1P29974 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cnga1P29974 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cnga1P29974 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Cnga1P29974 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Cnga1P29974 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cnga1P29974 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cnga1P29974 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cnga1P29974 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cnga1P29974 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Cnga1P29974 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cnga1P29974 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.7 ms