Protein–RNA interactions for Protein: P29037

Tbp, TATA-box-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbpP29037 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TbpP29037 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbpP29037 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbpP29037 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbpP29037 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TbpP29037 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbpP29037 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbpP29037 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TbpP29037 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TbpP29037 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TbpP29037 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TbpP29037 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TbpP29037 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TbpP29037 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TbpP29037 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TbpP29037 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TbpP29037 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TbpP29037 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TbpP29037 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TbpP29037 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TbpP29037 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TbpP29037 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TbpP29037 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TbpP29037 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TbpP29037 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TbpP29037 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TbpP29037 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TbpP29037 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TbpP29037 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TbpP29037 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TbpP29037 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TbpP29037 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TbpP29037 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TbpP29037 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TbpP29037 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TbpP29037 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TbpP29037 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TbpP29037 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TbpP29037 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TbpP29037 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TbpP29037 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TbpP29037 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TbpP29037 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TbpP29037 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TbpP29037 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TbpP29037 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TbpP29037 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TbpP29037 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TbpP29037 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TbpP29037 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TbpP29037 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TbpP29037 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TbpP29037 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TbpP29037 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TbpP29037 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TbpP29037 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TbpP29037 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TbpP29037 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TbpP29037 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TbpP29037 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TbpP29037 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TbpP29037 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TbpP29037 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TbpP29037 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TbpP29037 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TbpP29037 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbpP29037 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TbpP29037 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbpP29037 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TbpP29037 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbpP29037 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbpP29037 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TbpP29037 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbpP29037 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TbpP29037 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbpP29037 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbpP29037 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbpP29037 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TbpP29037 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TbpP29037 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbpP29037 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbpP29037 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbpP29037 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbpP29037 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbpP29037 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbpP29037 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TbpP29037 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbpP29037 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbpP29037 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TbpP29037 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbpP29037 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbpP29037 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbpP29037 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TbpP29037 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TbpP29037 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbpP29037 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TbpP29037 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TbpP29037 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TbpP29037 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TbpP29037 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms