Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LynP25911 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LynP25911 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LynP25911 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LynP25911 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LynP25911 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LynP25911 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LynP25911 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LynP25911 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LynP25911 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LynP25911 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LynP25911 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LynP25911 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LynP25911 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LynP25911 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LynP25911 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LynP25911 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LynP25911 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LynP25911 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LynP25911 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LynP25911 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LynP25911 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LynP25911 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LynP25911 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LynP25911 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LynP25911 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LynP25911 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LynP25911 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LynP25911 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LynP25911 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LynP25911 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LynP25911 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LynP25911 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LynP25911 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LynP25911 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LynP25911 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LynP25911 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LynP25911 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LynP25911 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LynP25911 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LynP25911 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LynP25911 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LynP25911 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LynP25911 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LynP25911 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LynP25911 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LynP25911 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LynP25911 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LynP25911 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LynP25911 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LynP25911 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LynP25911 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LynP25911 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LynP25911 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LynP25911 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LynP25911 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LynP25911 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LynP25911 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LynP25911 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LynP25911 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LynP25911 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LynP25911 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LynP25911 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LynP25911 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LynP25911 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LynP25911 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LynP25911 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LynP25911 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LynP25911 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LynP25911 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LynP25911 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LynP25911 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LynP25911 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LynP25911 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LynP25911 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LynP25911 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LynP25911 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LynP25911 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LynP25911 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LynP25911 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LynP25911 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LynP25911 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LynP25911 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LynP25911 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LynP25911 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LynP25911 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LynP25911 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LynP25911 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LynP25911 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LynP25911 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LynP25911 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LynP25911 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LynP25911 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LynP25911 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LynP25911 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LynP25911 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LynP25911 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LynP25911 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LynP25911 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LynP25911 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms