Protein–RNA interactions for Protein: P23881

Tcea3, Transcription elongation factor A protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea3P23881 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcea3P23881 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcea3P23881 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcea3P23881 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcea3P23881 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcea3P23881 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcea3P23881 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcea3P23881 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcea3P23881 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcea3P23881 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcea3P23881 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tcea3P23881 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tcea3P23881 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tcea3P23881 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tcea3P23881 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms