Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pou4f1P17208 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pou4f1P17208 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pou4f1P17208 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pou4f1P17208 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pou4f1P17208 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Pou4f1P17208 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pou4f1P17208 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pou4f1P17208 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pou4f1P17208 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.9 ms