Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa1P11477 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa1P11477 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa1P11477 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Defa1P11477 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Defa1P11477 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Defa1P11477 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa1P11477 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa1P11477 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Defa1P11477 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Defa1P11477 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Defa1P11477 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa1P11477 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa1P11477 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms