Protein–RNA interactions for Protein: P03899

Mtnd3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd3P03899 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mtnd3P03899 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtnd3P03899 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mtnd3P03899 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtnd3P03899 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Mtnd3P03899 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtnd3P03899 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mtnd3P03899 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtnd3P03899 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Mtnd3P03899 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mtnd3P03899 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtnd3P03899 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mtnd3P03899 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mtnd3P03899 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mtnd3P03899 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mtnd3P03899 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mtnd3P03899 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mtnd3P03899 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mtnd3P03899 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mtnd3P03899 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mtnd3P03899 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms