Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccl20O89093 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccl20O89093 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccl20O89093 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccl20O89093 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccl20O89093 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccl20O89093 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccl20O89093 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccl20O89093 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccl20O89093 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccl20O89093 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccl20O89093 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccl20O89093 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccl20O89093 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccl20O89093 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccl20O89093 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl20O89093 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccl20O89093 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl20O89093 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl20O89093 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccl20O89093 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl20O89093 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl20O89093 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccl20O89093 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl20O89093 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl20O89093 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccl20O89093 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccl20O89093 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccl20O89093 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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