Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Stx8O88983 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Stx8O88983 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stx8O88983 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Stx8O88983 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx8O88983 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx8O88983 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stx8O88983 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Stx8O88983 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx8O88983 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Stx8O88983 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stx8O88983 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stx8O88983 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Stx8O88983 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Stx8O88983 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Stx8O88983 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Stx8O88983 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stx8O88983 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Stx8O88983 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Stx8O88983 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Stx8O88983 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Stx8O88983 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Stx8O88983 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stx8O88983 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Stx8O88983 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stx8O88983 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stx8O88983 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Stx8O88983 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Stx8O88983 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stx8O88983 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Stx8O88983 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx8O88983 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Stx8O88983 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Stx8O88983 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Stx8O88983 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stx8O88983 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stx8O88983 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Stx8O88983 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stx8O88983 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stx8O88983 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Stx8O88983 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Stx8O88983 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Stx8O88983 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx8O88983 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Stx8O88983 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Stx8O88983 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.6 ms