Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

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Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Serf1O88892 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Serf1O88892 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Serf1O88892 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Serf1O88892 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Serf1O88892 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serf1O88892 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serf1O88892 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Serf1O88892 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Serf1O88892 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Serf1O88892 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Serf1O88892 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Serf1O88892 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Serf1O88892 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Serf1O88892 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Serf1O88892 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms