Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hcn2O88703 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hcn2O88703 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcn2O88703 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hcn2O88703 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hcn2O88703 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hcn2O88703 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hcn2O88703 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hcn2O88703 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hcn2O88703 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms