Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Parp2O88554 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Parp2O88554 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Parp2O88554 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Parp2O88554 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Parp2O88554 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Parp2O88554 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Parp2O88554 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Parp2O88554 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Parp2O88554 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Parp2O88554 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Parp2O88554 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Parp2O88554 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Parp2O88554 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Parp2O88554 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Parp2O88554 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Parp2O88554 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Parp2O88554 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Parp2O88554 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Parp2O88554 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Parp2O88554 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Parp2O88554 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Parp2O88554 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Parp2O88554 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Parp2O88554 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Parp2O88554 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Parp2O88554 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms