Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nthl1O35980 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nthl1O35980 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nthl1O35980 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Nthl1O35980 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nthl1O35980 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nthl1O35980 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nthl1O35980 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nthl1O35980 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nthl1O35980 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nthl1O35980 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nthl1O35980 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nthl1O35980 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nthl1O35980 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nthl1O35980 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms